在本作中“爱丽丝”是特殊能力的代称，拥有的人可以做到一些平常人做不到的事情。“爱丽丝学院”就是专门为拥有“爱丽丝”的人开设的特别人才学校。在乡下长大的蜜柑和莹是青梅竹马的好朋友，但突然有一天蜜柑得知莹要转去一所名为“爱丽丝学园”的学校，心情很是低落，为了追寻玩伴，蜜柑也毅然的转到了那所学校，可她对的学院的一切都一无所知，所有东西都是她闻所未闻的事，更不明白特殊能力究竟意味着什么，不过尽管如此，她还是欢愉的和莹与周围的同学一起生活下去。