截止到2019年7月，《神奇宝贝》TV版有5部，剧场版有21部。
一、TV版顺序分别为：
1、《神奇宝贝无印篇》——1997年
讲述在关都地方真新镇生活的主人公小智，自大木博士处获得了皮卡丘、神奇宝贝球和神奇宝贝图鉴，以神奇宝贝大师为目标踏上了冒险之旅。阅历尼比道馆、枯叶道馆等激烈的道馆赛，与所到之处的神奇宝贝们邂逅。
2、《神奇宝贝超世代》——2002年
讲述小智和皮卡丘来到了新的舞台丰缘地方。那里有未知的宝可梦和尚不相识对手的战斗。在那里，他们邂逅了小遥和小胜姐弟。小遥的目标是成为顶级宝可梦协调训练家，和小智一起怀揣梦想和希望开始旅行。然后一行人的旅行舞台转为关都地方。
3、《神奇宝贝钻石与珍珠》——2006年
讲述以宝可梦大师为目标继续旅行的主人公小智和搭档皮卡丘来到了新的冒险舞台“神奥地区”。随后，他们与目标成为顶级协调训练家的小光和她的波加曼邂逅，一同踏上旅程。各种各样的邂逅，相识同伴的重要，在战斗中洋溢炽热的友情，不断成长。
4、《神奇宝贝超级愿望》——2010年
讲述精灵宝可梦，不可思议的生物。可是，还没有人相识所有的宝可梦。以成为宝可梦大师为目标，继续着旅程的小智和伙伴皮卡丘在合众地区的冒险又开始了。新的相遇，结识艾莉丝与宝可梦酒侍天桐的同时，各种各样的邂逅，相识同伴的重要，在战斗中洋溢炽热的友情，不断成长。
3、《神奇宝贝：结晶塔的帝王》——2000年
故事背景设定在美丽的绿地镇。小镇的居民之一，神奇宝贝博士秀力正在进行变幻莫测的神奇宝贝未知图腾的研究。他和他的助理发现了一座以及，但秀力被吸入了异次元。小美发现了一盒含有未知图腾画像的石板并开始摆弄，召唤出了未知图腾。
4、《精灵宝可梦：时拉比穿梭时空的相遇》——2001年
在森林的入口，“雪成”与少女“永久”邂逅了。接受了永久说的“如果你听到了森林的声音，就不能乱走动”的忠告后，雪成走进了森林。雪成在森林里为了守护被猎人追捕的“时拉比”，被“穿梭时空的力气”卷入，带到了40年后的未来。在40年后的世界，雪成认识小智他们。
5、《神奇宝贝：水都的守护神拉帝亚斯和拉帝欧斯》——2002年
小智一行人为了参加一年一度的神奇宝贝水上竞赛而来到奥多马雷。就在胜券在握之时，小锯鳄和小智却突然转入了错误的水道，而原本落后的小霞获得了胜利。之后，一行人受罗西的邀请坐上了奥多马雷的小舟。在舟上他们听罗西讲了拉帝欧斯和拉帝亚斯的传说。
6、《神奇宝贝：七夜的许愿星基拉祈》——2003年
为了观看千年彗星出现的那一瞬间，小智一行人前往将进行千年彗星庆典的游乐场。当他们跑到指南上所描述的地点时，却失望地发现这里是一片荒凉的旷地。由于天色已晚，他们便在这里吃晚饭，并决意在此露营过夜。
7、《神奇宝贝：裂空的访问者代欧奇希斯》——2004年
科学家伦多博士为了调查住在冰原的神奇宝贝而来到这里，他的儿子小超却意外被卷入坠落时产生的暴风。在一片的水蒸气中隐约现身的是神秘的神奇宝贝代欧奇希斯。就在这时候出现了宇宙神奇宝贝烈空坐，和代欧奇希斯展开激烈的战斗。而伦多博士和小超也被卷入他们的激斗中。
8、《神奇宝贝：梦幻与波导的勇者路卡利欧》——2005年
小智、皮卡丘、小刚、小遥和小胜来到了欧鲁德朗城参加赞颂亚朗的祭典。小智参加了庆典的神奇宝贝对战，并战胜了一名叫琪朵·夏玛兹的训练家的玛狃拉。当晚的皇家舞会上，小智一行人的神奇宝贝们跑到了阁楼上玩耍。
9、《精灵宝可梦：宝贝梦保育家与苍海的王子玛纳霏》——2006年
持续旅行的小智与皮卡丘一行人，遇到以表演水中神奇宝贝秀而闻名的小码头马戏团的“广美”。从可与水系神奇宝贝心灵相通的“水之民”的后裔广美口中，小智得知在水之民所建造的海之神殿亚克夏里面，藏有被称为“海之王冠”的秘宝。但是，据说人类的眼睛没有办法看到神殿。
10、《精灵宝可梦：帝牙卢卡VS帕路奇亚VS达克莱伊》——2007年
为了参加下一场神奇宝贝华丽大赛，小智、小光和小刚一行人正在前往白杨镇。但他们发现白杨镇在一座湖泊的正中央。在前往镇子的路上，两个次元的战斗仍在继续，并造成了大量气流冲击。艾莉丝之后载着他们来到了白杨镇。
11、《神奇宝贝：骑拉帝纳与冰空的花束洁咪》——2008年
洁咪逃出生天，来到了海滨小镇并遇到了小智一行人。小智一行人随即决意将洁咪带回同伴聚集的花田。火箭队三人组这时出现并试图抢走洁咪，但包括小智一行在内的一众人等被时空漩涡吞没进入了反转世界。
12、《神奇宝贝：阿尔宙斯超克的时空》——2009年
小智、小光和小刚与他们的神奇宝贝们来到了米季纳。一行人在前往小镇中的神殿的路上路过了一座湖泊。一条条水龙卷突然自湖中卷起，但一对兄妹希娜和克宾召唤出帝牙卢卡，后者平息了龙卷风。
13、《神奇宝贝：幻影的霸者索罗亚克》——2010年
王冠市是个水与绿茵、古街道与近代建筑完美调合的城市。为了观看正在这里进行的“神奇宝贝足篮世界杯”，小智一行人向王冠市前进。在途中，他们遇到了一只能够化身其他神奇宝贝和人类、名为“索罗亚”的不可思议的神奇宝贝。
14、《神奇宝贝：比克提尼与黑英雄捷克罗姆》——2011年
小智、艾莉丝和天桐正赶往艾茵多奥克，小智在悬崖边救起了一对四季鹿。小智毫无察觉地被比克提尼碰触被传递了力气，这使得他越过了峡谷落在了另一面，并同皮卡丘和四季鹿一起冒险穿越洞穴。
15、《神奇宝贝：酋雷姆VS圣剑士凯路迪欧》——2012年
在火车站，小智一行人登上了进城的火车。来到清风车站，火车暂时停靠。一行人来到站台上，在买了很多火红不倒翁便当当作午餐后回到车上。受伤的凯路迪欧摔到了车厢顶，被小智一行发现。凯路迪欧告诉一行人酋雷姆正在追杀它，它正在尝试逃跑。
16、《神奇宝贝：神速的盖诺赛克特超梦觉醒》——2013年
小智一行人来到了纽特市，他们的导游艾利克将他们带到了自然公园，还未对外开放的神奇宝贝山庄中。在那里，小智一行很快与水柱卡带的盖诺赛克特成为了朋友。这时，赤红盖诺赛克特和闪电卡带的盖诺赛克特现身并认为小智正在伤害水柱卡带的盖诺赛克特，随即发动攻击。
17、《精灵宝可梦：破坏之茧与蒂安希》——2014年
在地下深处，存在一个美丽的国家“钻石矿国”，有“宝石宝可梦”之称的小碎钻们在这里和平生活。就在这样的背景下，矿国的公主蒂安希遇到了小智和皮卡丘。为了寻求神圣之力，他们踏上了寻找“生命宝可梦”哲尔尼亚斯的旅程。
18、《精灵宝可梦：光环的超魔神胡帕》——2015年
小智与皮卡丘等人在旅行途中，遇见拥有“能取出任何物体的光环”的幻之宝可梦——胡帕，以及照顾它的少女——梅雅利。爱捣蛋的胡帕，以从神奇光环中拿初塔最爱吃的甜甜圈，还有各种物品来吓人为乐。成为好朋友的胡帕跟小智等人一起旅行。
19、《精灵宝可梦：波尔凯尼恩与机巧的玛机雅娜》——2016年
该片讲述了小智被波尔凯尼恩和不可思议的锁链所连接，被波尔凯尼恩拖着到达了超级机关城市阿佐特王国。在那里，大臣贾维斯企图支配王国。一直接洽着的小智和波尔凯尼恩，齐心协力挑战救出玛机雅娜。
20、《精灵宝可梦：就决意是你了》——2017年
住在真新镇的少年小智，迎来了能获得宝可梦训练家资格的10岁生日早晨。对从未见过的宝可梦，与从未见过的世界感到憧憬的他，应该到大木研究所领取要成为自己伙伴的宝可梦，可是小智睡过了头，等他抵达时只剩一只不喜欢人类的皮卡丘。
21、《精灵宝可梦：大家的故事》——2018年
小智和皮卡丘偶然到达风来城参加“风节”，遇上了宝可梦新手训练家利莎、喜欢吹牛的吹牛大叔卡戛其、没有自信的懦弱研究家托里托、讨厌宝可梦的怪婆婆翡翠，还有独自伫足森林的神秘少女拉茹果。他们5人各有各的烦恼，以至无法和自己的宝可梦拍档更进一步，作出改变。